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应用科学学院于1998年4月由原哈尔滨理工大学基础教学一部、基础教学二部和技术物理系合并组建，原哈尔滨理工大学技术物理系在合校前为哈尔滨科学技术大学技术物理系，是我国著名科学家、中国科学院院士、中国工程院院士王大珩建议，于1978年6月成立的。